新華社南京12月3日電(記者陳席元)RNA甲基化修飾被認(rèn)為是控制基因表達(dá)的“開關(guān)”,但長期以來,該領(lǐng)域研究中有關(guān)基因位點(diǎn)是否有修飾的實(shí)驗(yàn)結(jié)果并不穩(wěn)定。
記者3日從位于江蘇蘇州的西交利物浦大學(xué)獲悉,該校助理教授魏震團(tuán)隊(duì)綜合近1400種研究數(shù)據(jù),開發(fā)可交叉驗(yàn)證的RNA甲基化修飾位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫,為今后評(píng)價(jià)相關(guān)實(shí)驗(yàn)結(jié)論是否可靠提供參考。研究成果3日發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》上,并向全球免費(fèi)開放。
魏震介紹,RNA甲基化修飾能控制基因的表達(dá),被認(rèn)為與多種疾病密切相關(guān),也是近年來國內(nèi)外生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。
然而,該領(lǐng)域長期面臨一大難題,同一個(gè)基因、同一處位點(diǎn),采用不同的檢測方法,會(huì)得到大相徑庭的檢測結(jié)果。
“這篇論文認(rèn)為某位點(diǎn)有修飾,那篇論文認(rèn)為沒有修飾,令后來的研究者無所適從,只能重新測一遍,造成重復(fù)勞動(dòng)和資源浪費(fèi)。”魏震說。
團(tuán)隊(duì)想到,可以用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法回顧已有研究,檢驗(yàn)各類實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。
魏震告訴記者,過去兩年里,團(tuán)隊(duì)重點(diǎn)收集了東亞、北美、歐洲三大公共數(shù)據(jù)庫1393個(gè)生物學(xué)樣本的原始測序數(shù)據(jù),覆蓋了10種常用的RNA甲基化修飾檢測技術(shù)。
通過“正交驗(yàn)證”算法,團(tuán)隊(duì)識(shí)別出13.5萬個(gè)高置信度RNA甲基化修飾位點(diǎn),建成標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)一、直接可比的數(shù)據(jù)庫,目前已有24個(gè)國家的科研人員使用。
“這個(gè)數(shù)據(jù)庫將幫助科研人員區(qū)分實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)的信號(hào),哪些是可靠的生物學(xué)標(biāo)記,哪些只是實(shí)驗(yàn)噪音?!蔽赫鸨硎荆芯恐袌F(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)6000多個(gè)基因變異,其中有些變異與抑郁癥等復(fù)雜疾病的RNA甲基化修飾位點(diǎn)呈現(xiàn)高度相關(guān)性,有望為科學(xué)家探究疾病的分子機(jī)制提供新角度。
Copyright ? 2001-2025 湖北荊楚網(wǎng)絡(luò)科技股份有限公司 All Rights Reserved
互聯(lián)網(wǎng)新聞信息許可證 4212025003 -
增值電信業(yè)務(wù)經(jīng)營許可證 鄂B2-20231273 -
廣播電視節(jié)目制作經(jīng)營許可證(鄂)字第00011號(hào)
信息網(wǎng)絡(luò)傳播視聽節(jié)目許可證 1706144 -
互聯(lián)網(wǎng)出版許可證 (鄂)字3號(hào) -
營業(yè)執(zhí)照
鄂ICP備 13000573號(hào)-1
鄂公網(wǎng)安備 42010602000206號(hào)
版權(quán)為 荊楚網(wǎng) www.capatronics-ks.cn 所有 未經(jīng)同意不得復(fù)制或鏡像